Сколько времени в городе иркутск: Иркутск, Россия — точное время

159

153

153

112

105

80

80

64

35 90:00 2 ноя (местное время)

Анимированная трехмерная карта загрязнения воздуха

live Иркутск aqi рейтинг

Рейтинг качества воздуха в Иркутске в реальном времени

AQI города на основе спутниковых данных. В Иркутске наземных станций в настоящее время нет.

Иркутск Веб-камера

11:09, 1 ноя

Загрязнен ли воздух в Иркутске?

Обзор

Какое сейчас качество воздуха в Иркутске?

			Концентрация		Концентрация
PM2. 5		2,1 мкг / м³

Концентрация PM2,5 в воздухе Иркутска в настоящее время соответствует годовому нормативу качества воздуха ВОЗ

Рекомендации по охране здоровья

Как защититься от загрязнения воздуха в Иркутске?

Прогноз

Прогноз индекса качества воздуха (AQI) Иркутска

Заинтересованы в почасовом прогнозе? Скачать приложение

Исторический

Исторический график качества воздуха в Иркутске

Как лучше всего защититься от загрязнения воздуха?

Снизьте воздействие загрязнения воздуха в Иркутске

Где самый чистый воздух в Иркутске?

Загрязнение воздуха в Иркутске по местоположению

Сайты IQAir используют файлы cookie, чтобы улучшить ваш онлайн-опыт и показывать рекламу с учетом ваших интересов. Нажмите «Я СОГЛАСЕН» ниже, если вы даете согласие на использование файлов cookie для этих целей. Для получения дополнительной информации о том, как мы используем файлы cookie, в том числе о том, как управлять настройками файлов cookie, ознакомьтесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Я СОГЛАСЕН

В этот почасовой рейтинг вошли 0 станций Иркутска с PM2,5 AQI.

В этот почасовой рейтинг вошли 19 городов России с PM2,5 AQI.

Саудовская Аравия может поднять цены на легкую нефть для Азии в декабре

Сотрудник держит образец сырой нефти на Ярактинском месторождении, принадлежащем Irkutsk Oil Co, в Иркутской области, Россия, 11 марта 2019 года.REUTERS / Василий Федосенко

• Легкие сорта, поддерживаемые высокой рентабельностью дистиллятов
• Исследование показывает широкий разброс ценовых ожиданий
• Неясно, вернется ли Саудовская Аравия к формуле цены
• Слабая маржа на мазут может стать тормозом — источники

СИНГАПУР, 29 октября. (Рейтер) — Крупнейший экспортер нефти Саудовская Аравия может поднять цены на легкие сорта нефти в Азию в декабре, чему способствовал рост маржи дистиллятов и спотовых премий на ближневосточную нефть в этом месяце, сообщили источники в торговле в пятницу.

После снижения цен на два месяца подряд государственный нефтяной гигант Saudi Aramco может поднять официальную отпускную цену (OSP) на флагманскую нефть Arab Light на 30 центов до 90 центов в декабре, заявили шесть респондентов в опросе Reuters.

Повышение цен происходит в связи с тем, что нефтеперерабатывающие предприятия наращивают объемы производства для удовлетворения более высокого спроса, поскольку страны ослабляют ограничения на перемещение COVID-19, в то время как потребление нефти в энергетическом секторе растет на фоне глобального дефицита угля и природного газа. подробнее

Тем не менее, широкий диапазон значений в обзоре указывает на неопределенность в отношении того, сколько Saudi Aramco отметит цены на основе своей формулы ценообразования, заявили они, поскольку производитель снизил цены больше, чем ожидалось в последние месяцы, чтобы соблазнить покупателей. подробнее

«Они могут позволить себе вернуться к OSP на основе моделей», — сказал один респондент.

«Раньше их OSP были слишком высокими. Но после большого сброса саудовская (сырая) стоимость снова выглядит более соответствующей спотовым (уровням)».

Ежемесячное изменение спреда цен в первый и третий месяц для контрольного показателя Ближнего Востока в Дубае обычно определяет, насколько Саудовская Аравия повысит или снизит OSP Arab Light. В этом месяце спрэд расширился в среднем на 86 центов за баррель в результате бэквордации.При бэквордации быстрые цены выше, чем в будущие месяцы, что указывает на ограниченное предложение.

По другим сортам четыре респондента ожидают, что OSP Arab Heavy останется на прежнем уровне или вырастет, отслеживая высокие спотовые премии на иракскую нефть аналогичного качества, хотя двое других заявили, что снижение маржи мазута может привести к снижению цен.

OSP Arab Medium может также вырасти после того, как спотовая дифференциал нефти Banoco Arab Medium в этом месяце изменился на премию, сказал другой респондент.

Саудовская нефть OSP задала тренд для цен Ирана, Кувейта и Ирака, затронув около 9 миллионов баррелей в день (баррелей в сутки) сырой нефти, направляющейся в Азию.

Saudi Aramco, вероятно, опубликует ежемесячные цены после встречи между Организацией стран-экспортеров нефти и их союзниками 4 ноября.

Официальные лица Saudi Aramco из соображений политики не комментируют ежемесячные OSP королевства.

Ниже представлены ожидаемые цены в Саудовской Аравии на декабрь (в долларах за баррель по сравнению со средними показателями в Омане / Дубае): Ноябрь Изменение по состоянию на декабрь OSP

Arab Extra Light + 1.80 + 0.25 / + 1.15 + 2. 05 / + 2.95

Arab Light +1.30 + 0,30 / + 0,90 + 1,60 / + 2,20

Arab Medium +1,05 -0,10 / + 0,80 + 0,95 / + 1,85

Arab Heavy -0,10 -1,00 / + 0,70 -1,10 / + 0,60

Источник: Reuters, trade

Отчетность Флоренс Тан; Под редакцией Шерри Джейкоб-Филлипс

Наши стандарты: принципы доверия Thomson Reuters.

Изменение климата в последней великой пустыне планеты

Один из разрушительных лесных пожаров в августе 2021 года в Якутии, самой холодной территории России

Пока мировые лидеры и делегации собираются в Глазго на Конференцию ООН по изменению климата, вот наша открытка из Сибири, подчеркивающая то, как планета заметно меняется на наших глазах.

В наше время мы видим повсюду тревожные события, незнакомые нашим родителям, бабушкам и дедушкам.

Статистика показывает, что в 2020 году в России было на 3,2 градуса теплее, чем в среднем за три десятилетия до 1990 года. Зимние температуры мягче, чем когда-либо, с потеплением воздуха на 5 градусов выше нормы.

Количество лесных пожаров увеличилось в четыре раза, а вероятность штормов и ураганов в десять раз выше.

В 2003 году президент Владимир Путин пошутил, что «2-3 градуса [глобального потепления] не повредит.На шубы потратим меньше ».

Хотя он не поедет в Глазго, он недавно сказал: «Изменения и ухудшение состояния окружающей среды настолько очевидны, что даже самые нерадивые люди больше не могут их игнорировать.

«Можно продолжать научные дискуссии о механизмах происходящих процессов, но невозможно отрицать, что эти процессы ухудшаются, и что-то нужно делать.

«Стихийные бедствия, такие как засухи, наводнения, ураганы и цунами, стали почти новой нормой, и мы привыкаем к ним.

«Достаточно вспомнить разрушительные, трагические наводнения в Европе прошлым летом, пожары в Сибири — примеров много».

Вот восемь основных способов, которыми Сибирь меняется

Наши фотографии сделаны в двух разных местах, расположенных на расстоянии тысяч километров друг от друга: Северный Ледовитый океан и самый старый и самый глубокий пресноводный резервуар в мире, озеро Байкал.

В обоих случаях метан выделяется не так, как только поколение назад, из-за быстрого таяния вечной мерзлоты, которая запечатывала газ на десятки тысяч лет — до сих пор.

Разряды в море Лаптевых и Восточно-Сибирском море, наблюдавшиеся с научно-исследовательского судна «Академик Келдыш», показали высокие концентрации метана из подводных кратеров и «суперсифических отверстий» в тающем океаническом дне вечной мерзлоты.

Пузырьковые облака поднимаются с глубины около 300 метров (985 футов) вдоль большого подводного склона , как показывает наш вид.

«Они выглядят как дыры в вечной мерзлоте и, как показали наши исследования, образовались в результате массивного выброса метана», — пояснил профессор Игорь Семилетов.«Еще два мощных выхода метана через борозды айсбергов были обнаружены в Восточно-Сибирском море».

Ученые определили полдюжины «мега просачиваний» и обнаружили, что концентрация атмосферного метана над этими полями достигает 16-32 частей на миллион (частей на миллион). Это в 15 раз больше, чем в среднем по планете — 1,85 частей на миллион.

Теперь мы идем на юг, к величественному Байкалу, где под ледяным льдом озера, содержащего 20 процентов — да, пятую часть — незамерзшей пресной воды в мире, видны неземные образы.

Эти потусторонние формы подо льдом поражают своей природной артистичностью; , но под кристально чистой замороженной поверхностью они также сигнализируют об утечке метана .

В озере есть около двух десятков крупных глубоководных выходов метана — ниже 380 метров (1250 футов) — и сотни более мелких газовых фонтанов.

Количество метана, скрытого в газовых гидратах Байкала, оценивается в один триллион кубометров.

Сильные взрывы, произошедшие за последнее десятилетие или около того, вызвали образование по меньшей мере 20 гигантских кратеров на полуострове Ямал в северной части Сибири и рядом с ним.К лету 2021 года ученые идентифицировали около 7185 арктических курганов, потенциально подверженных риску извержения.

«Пять-шесть процентов из этих 7 185 курганов действительно опасны», — предупредил профессор Василий Богоявленский.

Газовые месторождения Бованенково, Новопортовское и Южный Тамбей находятся под угрозой, как и стратегический узел СПГ Сабетта стоимостью 27 миллиардов долларов, сказал он.

Некоторые из этих быстро развивающихся потенциально взрывоопасных выступающих холмов на полуостровах Ямал и Гыдан расположены недалеко от населенных пунктов и газовых месторождений, жизненно важных для энергоснабжения Европы.

Внутри «курганов» выделяется нестабильный метан из-за таяния вечной мерзлоты.

Одним из примеров было извержение летом 2020 года, оставившее кратер глубиной 40 метров (131 фут).

В результате взрыва 2018 в озере Открытие, его ледяной покров толщиной 1,5 метра (5 футов) был разбит обломками, разлетевшимися примерно в 50 метрах (165 футов) от эпицентра.

Около 65 процентов территории России — крупнейшей географической страны мира — покрыто вечной мерзлотой, и она быстро тает.Наши фотографии показывают некоторые из ужасных последствий, и в ближайшие годы кризис усугубится.

Отчеты предупреждают о резком снижении «несущей способности» наземных гостиниц, например, российской алмазной столицы Якутска и узла добычи никеля Норильск, построенных на вечной мерзлоте.

Когда-то использовавшиеся железнодорожные пути, построенные в сталинские времена в отдаленных уголках Сибири, например, в Забайкалье, теперь шаткие и искривленные из-за движения грунта из-за таяния вечной мерзлоты. Мосты тоже рухнули.

На снимке показано обрушение здания на 10 метров (33 фута).

Россия использовала проверенный метод строительства в районах вечной мерзлоты, забивая сваи глубоко в мерзлую землю. Но если земля больше не замерзает, вся реальность меняется. Появляются болота и озера, становятся нежизнеспособными поселки и даже города.

Никита Зимов, директор Северо-Восточной научной станции у Черского, отметил разрушения в течение двух лет неработающей станции очистки сточных вод в Якутии , самом холодном населенном регионе в мире.Он «сломался посередине», когда часть конструкции осела, а бетонная дорога, ведущая к заводу, провалилась в новый овраг, полностью исчезнув, сказал он.

Он предупредил: «Температура вечной мерзлоты повышается, и мы приближаемся к точке, когда она начнет таять повсюду, причем очень активно. Мы движемся к порочному кругу, когда потепление климата ускорит таяние вечной мерзлоты, что, в свою очередь, ускорит потепление климата и еще больше ускорит оттаивание, пока весь активный углерод не будет высвобожден из вечной мерзлоты.’

Со своего наблюдательного пункта Плейстоценовый парк, цель которого — восстановить фауну мамонтовых степей эпохи плейстоцена , он предвидит ужасные потери.

Вечная мерзлота тает намного быстрее, чем многие ожидали.

«Как только наша вечная мерзлота начнет таять, нам больше не нужно будет беспокоиться о заводах или каких-либо других источниках выбросов, потому что основной выброс метана будет происходить отсюда (в Арктике). И процесс пошел ».

Этот разрушительный релиз произойдет в мгновение ока эволюционной шкалы времени.

«Мы считаем, что этот процесс займет от 100 до 200 лет», — сказал Никита Зимов.

Его беспокоит верхний 40-метровый (130 футов) слой почвы, который «тревожно быстро» тает в Якутии.

Вечная мерзлота представляет собой твердую замороженную смесь почвы, песка и льда, лежащую под городами, поселками и обширными безлюдными территориями в полярных регионах. Состоящая до 500 гигатонн органического вещества, такого как корни древней травы, кустарников и деревьев, плюс останки животных — это вечная мерзлота только в Якутии, и по расчетному весу она тяжелее всей растущей сейчас биомассы Земли.

Это крупнейший в мире резервуар органического углерода, который при таянии превращается в парниковый газ, включая метан.

На новом спутниковом снимке видно расширение Батагайской впадины, — «огромную глыбу», которую местные жители прозвали Уста Ада. Гигантская дыра в форме головастика была измерена несколько лет назад на глубине 100 метров (330 футов), длиной около 1000 метров (3300 футов) и шириной 800 метров (2650 футов).

Ожидаются новые точные измерения этой трещины в земле, но снимок из космоса показывает, что она расширяется.Внутри кратера, как показывают наши снимки, вода, застывшая в почве на протяжении десятков тысяч лет, стекает струйками и вытекает, высвобождаясь из своего древнего зажима.

Куски тающей вечной мерзлоты падают со скал.

Сергей Федоров, научный сотрудник Института прикладной экологии в Якутске, сказал нам: «Одна из самых серьезных вещей, которые мы должны понять, глядя на этот спад, — это то, что мы, люди, не можем остановить его рост. Нельзя ставить занавеску от солнечных лучей, чтобы она не таяла.

‘Даже в начале сентября, когда температура воздуха опускается до нуля, можно увидеть родники и реки.

‘Когда вы стоите внутри провала на мягких кучах почвы, оставшихся после таяния льда, вы слышите, как он «разговаривает с вами», с треском льда и непрерывным монотонным журчанием ручьев и рек с водой. «

Спусковой крючок для образования его кратера был создан человеком в результате вырубки деревьев.

Затем наступило таяние вечной мерзлоты в Якутии, и теперь расширение идет быстрыми темпами.

Ежегодные открытия теперь делаются из останков вымерших шерстистых мамонтов или носорогов, а также давно исчезнувших пещерных медведей и доисторических лошадей. Таяние вечной мерзлоты дало ученым доступ к неисчислимым сокровищам прошлого, состоящим не только из костей, но и из плоти и меха, клеток и даже крови.

Ученые работают над тем, чтобы вернуть к жизни некоторые из этих видов, но у этих потерянных животных есть и другая сторона.

За последние пять лет на полуострове Ямал было выпущено возрожденных видов сибирской язвы, в результате которых погибли как люди, так и северные олени.

Сотни российских войск химической и биологической войны были развернуты для уничтожения зараженных останков оленей на Ямале. Распространение искорененной оспы остается угрозой.

Кладбище на реке Колыма было создано в 1890-х годах для захоронения умерших от крупной вспышки оспы. Сочетание таяния вечной мерзлоты и затопления — еще одно последствие изменения климата — создает риск повторного открытия таких могил.

Множество других опасностей таится в неглубоких арктических могилах людей и животных, которые могут быть открыты со льда спустя столетия или даже дольше.

Виктор Малеев, заместитель начальника Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии России, предупредил о появлении новых «гигантских вирусов», например, у шерстистых мамонтов, трупы которых теперь появляются регулярно.

«Их патология не доказана, мы должны продолжить их изучение», — сказал он. «Изменение климата преподнесет нам много сюрпризов. Я не хочу никого пугать, но мы должны быть готовы ».

Исследование, опубликованное в октябре 2021 года, показало, что бактерии Acinetobacter lwoffii , извлеченные из вечной мерзлоты возрастом тысячи или миллионы лет, были устойчивы к антибиотикам.

Бактерии родом из глубин веков, но имеют много общего с современными штаммами, сказал ученый доктор Николай Равин, руководитель лаборатории молекулярного клонирования Научного центра биотехнологии Российской академии наук.

«Наши коллеги получили аналогичные результаты, и ситуация пугающая», — предупредил он. «Глобальное потепление можно только замедлить, но его невозможно остановить, и оно может привести к появлению новых инфекций.

«Исследование этих потенциальных патогенов, которые сейчас погребены в вечной мерзлоте, может спасти нашу жизнь и здоровье в будущем. ’

В 2021 году произошли самые страшные лесные пожары в истории человечества. Если в этом году они находились южнее, то в прошлом году они более интенсивно бушевали на крайнем севере, за Полярным кругом.

Статистика потрясающая, а последствия для природы и жителей Сибири удручающие. Явление «дымящегося снега» в Томпонском районе Якутии подчеркивает новую норму.

Здесь под землей в талой вечной мерзлоте горит огонь круглый год, даже когда температура опускается ниже минус 50С.

На видео видны клубы дыма, поднимающиеся от огня зомби примерно в 400 км (250 миль) к северо-востоку от столицы республики Якутска, самого холодного города в мире.

Местный житель Иван Захаров, который снимал пожар ровно при минус 50 ° C в январе этого года, сказал The Siberian Times: «Он горит в том же районе, где летом произошли пожары.

«В этом районе была очень жаркая и засушливая погода. Это должно быть либо горящий торф, либо, как предполагают некоторые охотники, заметившие эти пожары, возможно, молодой уголь (бурый уголь).’

Самые сильные лесные пожары в этом году были зарегистрированы в первые дни мая года, когда снег и лед все еще лежали на земле, в окрестностях Оймякона, известного как самая холодная в мире постоянно заселенная деревня.

Огромное пламя бушевало на Дороге костей, построенной в советское время узниками репрессий на некоторых из самых холодных аванпостов мира.

Якутск и другие сибирские города были уничтожены токсичными парами от пожаров, в 95 раз превышающими допустимые уровни, а также дымом, который также распространялся через Тихий океан в Северную Америку.

Количество пожаров в Сибири в 2021 году превысило количество пожаров в остальном мире, вместе взятых, за год, когда произошел огромный ад в США, Испании и Турции.

Разрушение охватило территорию больше Португалии или штата Мэн.

«С начала июня они выбросили в атмосферу 800 миллионов тонн углекислого газа, что больше, чем годовые выбросы Германии, крупнейшего загрязнителя Европы», — сообщает The Times.

«Гринпис назвал одно из отдельных пожаров одним из претендентов на звание самого большого пожара на планете с момента начала регистрации.’

Дети с ужасом наблюдали, как в июле в Забайкалье в результате сильного наводнения обрушился мост. В Урюме подъемными водами смыло грузовик, но водитель чудом скрылся.

В Сибири могут быть наводнения и засухи одновременно, погодные «американские горки» с проливными дождями, но также и с продолжительными и выжженными периодами без осадков.

В один и тот же день в восьми часовых поясах от Урала до Тихого океана погодные и новостные сводки могут привлечь внимание к рекордным волнам жары, бурным рекам, засушливым периодам, несезонным снегам и торнадо.

В 2019 году произошло самое сильное наводнение в истории Иркутской области . Эпицентром был Тулун, где 83-летняя бабушка Анелла Данелюк позвонила своей семье, чтобы сказать, что внезапный поток воды достиг ее шеи, как она утверждала на комоде.

Она дала понять, что это был ее последний звонок перед тем, как она собиралась утонуть — и она была одной из десятков, кто умер и пропал без вести, когда реки поднялись на высоту до 14 метров (46 футов).

Тем не менее, именно продолжительные периоды засухи — в этом году на севере — привели к тому, что лесные пожары охватили всю Сибирь.

В прошлом году было эпическое зрелище — гигантский парусник «СТС Седов», пересекающий Северный Ледовитый океан из Азии в Европу. Экипаж почти не встречал значительных льдин на протяжении тысяч морских миль.

Сопровождающий российский ледокол оказался практически лишним, так как «Седов» рискнул пересечь Беринговое, Чукотское, Восточно-Сибирское, Лаптевское и Карское моря.

Путешествие четырехмачтового стального барка немецкого производства показывает, что Северный морской путь теперь жизнеспособно соединяет Тихий океан и Атлантический океан .

Как отличается от 142 лет назад.

Судно проплыло мимо места у Чукотки, где в 1878 году знаменитая экспедиция Вега застряла в паковых льдах на 11 месяцев, совершив первое в истории успешное плавание из Европы в Азию по арктическому морскому пути.

Иван Федюшин, второй офицер СТС «Седов», сказал: «Мы не встретили даже остатков ледяных полей.Можно сказать, что глобальные климатические изменения делают морские пути в полярных водах более доступными для всех типов судов ».

Это экономическое благо для России, и в ближайшие годы ожидается значительный рост торговли с использованием преимуществ северного маршрута.

Практический подход к обнаружению и надзору за новыми высокоустойчивыми микобактериями туберкулеза Пекин 1071-32-cluster

Исследовательские коллекции

Исследованные образцы включали M. tuberculosis ДНК, собранных в период с 1996 по 2020 год либо из удобных образцов, либо из проспективных или перекрестных образцов. секционные исследования.Образцы не были предвзятыми в отношении лекарственной устойчивости, сопутствующих заболеваний или других характеристик пациентов.

Исследование одобрено этическими комитетами НИИ фтизиопульмонологии (протокол 31.2 от 27 февраля 2017 г.) и Санкт-Петербургского института Пастера (протокол 41 от 14 декабря 2017 г.).

Все методы были выполнены в соответствии с соответствующими инструкциями и правилами.

Генотипирование

ДНК была выделена из культивированных M.tuberculosis методом CTAB ¹⁸ (российские изоляты из Северо-Запада России и Омска, изоляты из Беларуси, Казахстана, Японии, Китая, Вьетнама и Бразилии), набор DNA-Sorb-B (Интерлабсервис, Россия) (русский изоляты из Иркутска, Бурятии, Якутии), набор «Экспресс-ванна» (Syntol, Россия) (российские изоляты из Екатеринбурга и Ямало-Ненецкого автономного округа), инкубация при 98ºC и обработка ультразвуком в течение 15 мин (изоляты из Греции), три цикла горячей замораживание разрушения клеток (изоляты из Албании), набор GenoLyse® (Hain Lifescience) (изоляты из Эстонии). Для ПЦР использовали один микролитр ДНК, экстрагированной с использованием ультразвуковой обработки, кипячения или коммерческих наборов, и 10–20 нг ДНК, экстрагированной с использованием метода CTAB.

Сполиготипирование и MIRU-VNTR-типирование по 24 локусам проводили по стандартным протоколам ^19,20 .

База данных TB Profiler (http://tbdr.lshtm.ac.uk/) использовалась для генотипического выявления лекарственной устойчивости. Фенотипы МЛУ, пре-ШЛУ и ШЛУ были определены в соответствии с определениями Всемирной организации здравоохранения: МЛУ — штаммы, устойчивые к изониазиду и рифампицину; ШЛУ — резистентность к изониазиду, рифампицину, фторхинолону и инъекционным препаратам второго ряда; пре-ШЛУ — резистентность к изониазиду, рифампицину и либо фторхинолонам, либо инъекционным препаратам второго ряда.

Биоинформатика и филогенетический анализ

Филогенетический анализ древних штаммов Beijing на основе данных WGS, полученных в нашей лаборатории или полученных из SRA NCBI, был описан ранее ¹⁵ , и список инвентарных номеров проанализированных геномов представлен в та же публикация. Вкратце, короткие считывания секвенирования были сопоставлены с эталонным геномом M. tuberculosis h47Rv (NC_000962.3) с использованием Burrows-Wheeler Aligner v.0.7,12 ²¹ . Вызов однонуклеотидного полиморфизма (SNP) был выполнен с помощью SAMtools v.0.1.19 ²² . Файлы переменного формата вызовов (vcf) были аннотированы BSATool v.0.1 ²³ . Графическое представление деревьев было выполнено с использованием TreeGraph (http://treegraph.bioinfweb.info) и iTOL v3 (http://itol.embl.de). Полученные файлы VCF были использованы для анализа. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) с показателями качества ≥ 20 были использованы для филогенетического анализа с помощью программы IQTREE (http: // www.cibiv.at/software/iqtree) с помощью ModelFinder (http://www.iqtree.org/ModelFinder) с моделью замены GTR2 + FO + G4 и 1000 репликаций быстрой начальной загрузки. SNP, расположенные в повторяющихся областях генома и в генах PE и PPE, были удалены из анализа из-за возможных несовпадений.

Для оценки значимости аминокислотных замен мы использовали 4 параметра: U-индекс Танга, D-расстояние Грантама, расстояние BLOSUM62 и логарифм Дейхоффа. Они были рассчитаны с использованием собственных скриптов, в частности, программы snpMiner2 ²⁴ .

ПЦР в реальном времени

Три SNP в положениях генома 170505, 451510 и 398918, специфичных для кластера Beijing 1071-32, были протестированы с помощью анализов ПЦР в реальном времени, которые выполнялись в тех же условиях цикла. Олигонуклеотидные праймеры и зонды, меченные FAM и HEX, перечислены в таблице 1.

Смесь для ПЦР (25 мкл) содержала 3 мМ MgCl ₂ , 1 единицу ДНК-полимеразы горячего старта Taq , 200 мкМ каждого dNTP, а также праймеры (8 пмоль каждый) и зонды (4 пмоль каждый).Были использованы термоциклеры RotorGene6000 (Corbette Research) и CFX96 (Biorad) при следующих условиях циклирования: 95 ° C, 10 мин; с последующими 40 циклами 95 ° C, 30 с; 60 ° C, 10 с, 72 ° C, 20 с (обнаружение сигнала при 60 ° C на длине волны 510 нм для FAM и 555 нм для HEX). Не было обнаружено различий между результатами, полученными в разных термоциклерах.

Обнаружение мутаций устойчивости к лекарствам

Ранее было показано, что шесть мутаций устойчивости к лекарственным средствам специфичны для Beijing 1071-32-cluster ¹⁵ : KatG Ser315Thr, KatG Ile335Val, RpoB Ser450Leu, RpoC Asp485Asn, EmbB Gln497Arg, RpsL Lys43.Для обнаружения этих мутаций мы использовали разные методы, некоторые из которых были описаны ранее, а именно.

Анализ обратной гибридизации с рифолиготипированием использовали для обнаружения мутаций в области горячей точки rpoB ²⁵ . Другие мутации были обнаружены с помощью аллель-специфической ПЦР или ПЦР-ПДРФ с последующим электрофорезом в 1,5% агарозном геле (таблица 2). Все методы были первоначально протестированы и оптимизированы с использованием образцов ДНК изолятов Beijing 1071-32 с доступными данными WGS и h47Rv в качестве контроля дикого типа.

Аллель-специфическая ПЦР была использована для специфического обнаружения мутации rpoC 485 GAT> AAT; праймеры были выбраны с помощью онлайн-инструмента WASP по адресу https://bioinfo.biotec.or.th/WASP/home. Оба аллель-специфических праймера содержали несовпадение в положении -1 на 3′-конце для увеличения нестабильности во время отжига и повышения специфичности. Для каждого штамма проводили две отдельные реакции ПЦР в одних и тех же условиях ПЦР и с использованием одного и того же прямого праймера и аллель-специфичных мутантных праймеров.Продукты ПЦР для обеих реакций идентичны (130 п.н.) и подвергаются гель-электрофорезу на соседних дорожках для каждого штамма для облегчения сравнения.

katG315 Мутация AGC> ACC была обнаружена с помощью анализа ПЦР – ПДРФ, как описано ²⁶ . Эта мутация создает дополнительный сайт для MspI , и основные полосы переваривания имеют размер 153 и 132 п.н. в случае аллелей дикого типа и мутантных аллелей соответственно.

katG335 Мутация ATC> GTC была обнаружена с помощью анализа ПЦР – ПДРФ.Эта мутация создает дополнительный сайт для AvaII , и основные продукты переваривания имеют размеры 378 и 285 п.н. в случае аллелей дикого типа и мутантных аллелей соответственно.

rpsL 43 AAG> AGG был обнаружен с помощью анализа ПЦР – ПДРФ. Эта мутация происходит в пределах единственного сайта MboII в продукте ПЦР в случае аллеля дикого типа. Основные продукты расщепления MboII составляют 210 и 60 п.н. в случае аллеля дикого типа и 270 п.н. в случае мутации.

embB 497 CAG> CGG был обнаружен с помощью анализа ПЦР – ПДРФ. Эта мутация создает дополнительный сайт для MspI , и основные продукты переваривания имеют размер 170 и 135 п.н. в случае аллелей дикого типа и мутантных аллелей соответственно.

ЭКРАН ДЛЯ НОУТБУКА от $ 34,99, замена ЖК-экранов. Ремонт планшета, Acer, Apple, iPhone, iPad, Samsung, Dell, HP Compaq, Toshiba, IBM, Lenovo, Sony, Asus, Gateway.

Нью-Йорк, Беллингем, Форт Ли, Ливан, Титусвилл, Бронкс, Пайнвиль, Терраса, Перл, Кливленд, Рокфорд, Джексон, Кошоктон, Роджерс, Лос-Анджелес, Майами, Чикаго, Фейетвилл, Элко, Сиэтл, Эверетт, Спокан, Портленд, Салем , Юджин, Медфорд, Сан-Франциско, Сан-Хосе, Сакраменто, Реддинг, Фресно, Сан-Диего, Иглы, Лас-Вегас, Феникс, Ногалес, Солт-Лейк-Сити, Флагстафф, Санта-Фе, Эль-Пасо, Миссула, Хелена, Бойсе, Денвер, Колорадо Источники, Бисмарк, Св.Пол, Гранд-Форкс, Мэдисон, Мурхед, Биллингс, Айдахо-Фолс, Остин, Даллас, Оклахома-Сити, Таллахасси, Колумбия, Атланта, Канзас-Сити, Нэшвилл, Линкольн, Спрингфилд, Де-Мойн, Анкоридж, Юрика, Бетал

Ванкувер, Калгари, Ла Ронге, Иннисфил, Макгрегор, Бароны, Саскатун, Тандер-Бей, Эстеван, Уотсон-Лейк, Анкастер, Крейвен, Альберта-Бич, Реджина, Ллойдминстер, Эйрдри, Шербрук, Уикхэм, Гамильтон, Эдмонтон, Корнуолл, Монреаль, Келоуна, Ферни, Дункан, Виктория, Лососевая рука, Оттава, Торонто, Галифакс, Квебек, Виннипег, Йеллоунайф, Уайтхорс, Сент-Джонс, Норт-Бэй

Рио-де-Жанейро, Монтевидео, Буэнос-Айрес, Мехико, Сантьяго, Лима, Кито, Гуаякиль, Ла-Пас, Сукре, Асунсьон, Бразилиа, Сальвадор, Кайенна

Берлин, Лиссабон, Монтихо, Пембрук, Крит, Вена, Эрланген, Аген, Мадрид, Брюссель, Уилтшир, Клайпеда, Марино, Майо, Дерби, Гренхен, Бургас, Каван, Дублин, Барселона, Верчелли, Торси, Нордборг, Блуа, Берген, С.Ланаркшир, Саллоники, Больцано, Парма, Оулу, Хенсис, Амстердам, Лион, Ганновер, Ремшайд, Краков, Вроцлав, Арнскадсвик, Аникщяй, Вильнюс, Эдинбург, Упсала, Лондон, Париж, Рим, Хамрун, Веракрус

Москва, Воронеж, Киев, Санкт-Петербург, Новосибирск, Донецк, Борисов, Владивосток, Бийск, Хабаровск, Красноярск, Иркутск, Омск, Екатеринбург, Челябинск, Казань, Нижний Новгород, Киров, Уфа, Пермь, Мурманск, Тверь

Триполи, Йоханнесбург, Кейптаун, Адехе, Найроби

Пекин, Гонконг, Токио, Ливан, Измир, Рамат-Ган, Сабах, Тбилиси, Ереван

Сидней, Дарвин, Мельбурн, Брисбен, Пресноводный, Виктория, Пинкенба, Перт, Аделаида, Канберра, Полуостров, Олбани, Эсперанс